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mdadm Ubuntu使用教程

1. 第一步是创建RAID阵列 mdadm --create --verbose /dev/md0 --level=5 --raid-devices=`硬盘数量` /dev/sda /dev/sdb

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Linux硬盘扩容

最近在玩OrangePi,并且给我原来的32G的系统盘拷贝到了256G的硬盘上,这时候默认启动之后还是使用的是32G空间。 而且就算调用了resize2fs会告诉你已经分配全部空间了。 参考https

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dd命令备份坏块硬盘时命令

# dd if=/dev/sde1 of=backup.img conv=sync,noerror status=progress 简单做一个记录,其中sync作用是遇到坏块时以0填充,保证字节的相

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Windows11利用Msys(Mingw64)编译R 非Rtools

注意注意,按照这个方式编译后的R,很多Rcpp开头的包都要源码方式重新编译安装,否则会出错!! 首先,我之所以会做这个事情是因为我某次更新win11之后,发现我的所有R包全都用不了了。于是乎我更新了R

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ANNOVAR的天坑问题

现在对于突变结果的注释,很多人会采用ANNOVAR进行。 但是我最近发现一个ANNOVAR很难发现的一个天坑问题。 一般情况下,我们都是直接调用table_annovar.pl 脚本对vcf文件直接进

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绘制非等高桑基图

很多时候,我们会有绘制非等高桑基图的需求。 本来我这个文章写了一次了,结果服务器出问题提交失败了。所以没耐心再写一次。 我就直接贴代码说明一下代码吧。 library(ggalluvial) libr

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主成分分析(PCA)从入门到理解

网络上有很多关于PCA的文章,不得不说其实这个概念本身是不难的,然后网上就出现了很多各种各样的理解和解读,反而加大了大家对于这个概念的理解难度。 最近我发现生物信息学之中对于PCA的应用挺常见的,但是

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WGCNA简单原理记录

WGCNA,全名加权基因网络分析,目的是更好的使用基因在样本中的表达量去衡量基因与基因之间的关系。 本文不涉及WGCNA的具体实践,也不涉及具体公式推导和证明,有需要者可以直接参考R包WGCNA的教程

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RNASeq差异表达中标准化方法集合 (RPKM,FPKM,TPM,DESeq,edgeR)

在计算RNASeq流程之中的表达量差异,也就是比较不同样本之间的RNA测序reads数的差异 (因为我们认为表达量大的基因,RNA量也会大,反转录的cDNA量也会大,那么测序的结果这部分的cDNA覆盖

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Grep正则表达式

Grep可以说是一个非常好用,而且经常使用的工具。 但是在使用的grep的时候,经常会遇到一些问题。 最近在进行数据的剔除,所以使用grep的正则表达式进行处理。 正则表达的规则如下: () 括号中是

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